More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1343 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1343  porin  100 
 
 		 355 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  86.97 
 
 		 390 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  86.78 
 
 		 348 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  87.07 
 
 		 348 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1952  porin  87.07 
 
 		 348 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0650784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  86.46 
 
 		 347 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2489  outer membrane porin  76.38 
 
 		 421 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2373  outer membrane porin  76.38 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2332  outer membrane porin  76.07 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2113  porin  76.62 
 
 		 420 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1473  outer membrane porin, putative  76.07 
 
 		 355 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1966  porin  76.07 
 
 		 355 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3339  porin  76.07 
 
 		 355 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.205333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1240  porin  76.07 
 
 		 355 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  45.22 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  39.29 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  35.36 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  34.83 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.89 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.89 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.89 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.96 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  35.94 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.88 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.98 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  33.92 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.17 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.67 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.78 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  35.36 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  33.63 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  33.63 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  31.62 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  31.88 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  31.62 
 
 		 386 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.71 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  32.61 
 
 		 361 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.6 
 
 		 402 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  32.02 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.65 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  31.09 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.29 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.75 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.49 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.77 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.77 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  31.97 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.55 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  30.05 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.3 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.54 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  30.83 
 
 		 413 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.87 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.98 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  30.48 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  29.69 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  30.17 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  31.55 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  31.55 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  31.55 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  32.11 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  32.11 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  31.34 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  32.8 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  31.8 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  33.15 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  29.89 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.97 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  27.61 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  35.26 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  31.25 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.05 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  29.35 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  30.36 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.76 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  36.57 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  36.57 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  36.57 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  30.73 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  30.36 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  30.36 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  30.86 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  36.74 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  29.67 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  29.67 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  29.67 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  36.45 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  29.67 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.69 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.27 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  32.53 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  31.9 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  33.94 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  29.4 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.16 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>