More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5683 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
297 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
217 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
242 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.32 
 
 
220 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
256 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.32 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.32 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.32 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
240 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.32 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  26.95 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  30.72 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.85 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  19.33 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  23.49 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  24.1 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.1 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  23.49 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  23.49 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.1 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
200 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
194 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 
211 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
197 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  20.61 
 
 
209 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  27.78 
 
 
211 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
196 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
271 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
201 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
217 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
231 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 
218 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
219 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
211 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
770 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>