More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5230 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  100 
 
 		 348 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  92.53 
 
 		 348 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1952  porin  92.53 
 
 		 348 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0650784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  91.95 
 
 		 390 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  91.86 
 
 		 347 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  86.49 
 
 		 355 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2489  outer membrane porin  78.53 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2373  outer membrane porin  78.53 
 
 		 355 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1473  outer membrane porin, putative  78.22 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3339  porin  78.22 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.205333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1966  porin  78.22 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2332  outer membrane porin  77.91 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2113  porin  78.77 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1240  porin  78.22 
 
 		 355 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  47.93 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  39.22 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  37.06 
 
 		 377 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  35.11 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  35.11 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  38.55 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  36.77 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  34.62 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  36.93 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  37.5 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  37.02 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  36.14 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  35.28 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  35.1 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.62 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  33.7 
 
 		 401 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  36.01 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.96 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.96 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  34.31 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.1 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.25 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  35.56 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  32.97 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  33.9 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.43 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  33.69 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  32.97 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.02 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  32.45 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.12 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  31.85 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  31.85 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  33.7 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  31.96 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  33.61 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34.02 
 
 		 359 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  32.4 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.73 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.73 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  32.94 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  32.75 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  33.97 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.23 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  32.12 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  35.73 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  34.05 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  34.05 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.05 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  34.15 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  34.15 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  34.15 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.74 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  30.77 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.35 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  32.97 
 
 		 373 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  33.16 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  30.03 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.5 
 
 		 389 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  31.67 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  33.13 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  30.77 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.37 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.82 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  30.85 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  31.57 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  31.12 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  32.71 
 
 		 373 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  32.71 
 
 		 373 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  32.71 
 
 		 373 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  32.97 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.55 
 
 		 363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.24 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.17 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  31.56 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>