More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3981 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3981  ROK family protein  100 
 
 		 402 aa  782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.73 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  36.01 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  30.21 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.13 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  35.29 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  30.34 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  36.1 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  27.96 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  30.51 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  30.12 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  34.89 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.18 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  30.17 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.94 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  29.38 
 
 		 393 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  31.01 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.13 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  31.31 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  28.12 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.72 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  27.51 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  30.24 
 
 		 402 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  29.76 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  29.85 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.05 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.24 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  27.5 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.37 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  28.5 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.33 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.7 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  24.87 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.08 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.5 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  31.23 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.13 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.25 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.37 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.14 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  25.07 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.36 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  25.76 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  26.73 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.92 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  23.08 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  22.93 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  31.23 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  29.65 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.34 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  29.12 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.46 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.27 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.02 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.46 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.81 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  29.27 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  28.99 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.05 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  23.9 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  29.4 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.43 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.56 
 
 		 342 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.05 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  21.85 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.05 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  22.05 
 
 		 383 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.15 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.17 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  22.45 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.24 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.75 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  27.76 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.96 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.28 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  28.01 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  32.7 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  28.63 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  31.95 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  22.98 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  22.98 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.2 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  28.48 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  22.98 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  27.91 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  23.75 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  23.75 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  23.31 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  23.31 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  24.82 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  23.31 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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