More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1692 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  28.04 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 259 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 259 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.03 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  23.51 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  34.53 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  26.53 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  23.39 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.17 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  30.39 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.62 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  23.64 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  29.28 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  26.47 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1981  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  21.17 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.37 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.87 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  22.46 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  35.9 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>