More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5552 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  82.12 
 
 		 491 aa  834    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  75 
 
 		 487 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  81.7 
 
 		 491 aa  838    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  81.91 
 
 		 491 aa  843    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  44.62 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  44.62 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  44.62 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  45.55 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  49.46 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  33.98 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 347 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  34.82 
 
 		 383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.45 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.16 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.85 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 330 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 330 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.53 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.53 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 334 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.18 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 501 aa  127  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 380 aa  127  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.93 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 398 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 359 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 347 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 347 aa  121  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 358 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 335 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 381 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.81 
 
 		 561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.09 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.47 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  29.69 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  23.19 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.42 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  31.01 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  26.85 
 
 		 375 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 375 aa  114  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 368 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.45 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.35 
 
 		 422 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 342 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>