More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0949 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  40.36 
 
 
994 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  70.19 
 
 
1015 aa  1519    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  40.38 
 
 
978 aa  701    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  100 
 
 
1023 aa  2093    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  66.14 
 
 
1018 aa  1373    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  86.61 
 
 
1016 aa  1828    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  39.17 
 
 
1003 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  70.58 
 
 
1015 aa  1532    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  69.89 
 
 
1015 aa  1510    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  99.22 
 
 
1049 aa  2079    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  32.06 
 
 
970 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  31.94 
 
 
970 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  32.72 
 
 
973 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  32.65 
 
 
975 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  32.34 
 
 
973 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  48.71 
 
 
427 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  49.18 
 
 
427 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  30.86 
 
 
974 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  48 
 
 
427 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  31 
 
 
910 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  45.15 
 
 
434 aa  380  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  47.28 
 
 
442 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  47.48 
 
 
416 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  44.06 
 
 
427 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  43.9 
 
 
434 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  44.71 
 
 
424 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.76 
 
 
429 aa  363  9e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  43.99 
 
 
981 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  43.76 
 
 
981 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  43.76 
 
 
981 aa  349  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  43.66 
 
 
433 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  43.81 
 
 
436 aa  347  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  45.33 
 
 
448 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  45.43 
 
 
427 aa  340  5.9999999999999996e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  45.95 
 
 
443 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  40.76 
 
 
465 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  42.52 
 
 
447 aa  337  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  40.67 
 
 
970 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.6 
 
 
977 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  41.78 
 
 
458 aa  324  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  40.76 
 
 
967 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  41.71 
 
 
448 aa  320  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  37.84 
 
 
966 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  42.55 
 
 
446 aa  319  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  42.34 
 
 
448 aa  319  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  41.22 
 
 
976 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  42.08 
 
 
447 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  40.49 
 
 
976 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  44.03 
 
 
436 aa  308  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  43.62 
 
 
436 aa  304  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  44.24 
 
 
436 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  40.61 
 
 
413 aa  300  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 
437 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  36.73 
 
 
436 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  35.08 
 
 
431 aa  227  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.17 
 
 
465 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.55 
 
 
436 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  36.13 
 
 
373 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  34.47 
 
 
431 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 
428 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 
461 aa  211  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.89 
 
 
465 aa  210  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.64 
 
 
446 aa  210  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 
360 aa  207  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
345 aa  207  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  39.37 
 
 
345 aa  207  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  39.05 
 
 
371 aa  205  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 
427 aa  204  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  34.45 
 
 
433 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 
430 aa  201  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  34.21 
 
 
433 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 
444 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  39.76 
 
 
351 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 
374 aa  199  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  32.43 
 
 
445 aa  197  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.32 
 
 
454 aa  197  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  33.9 
 
 
433 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  32.78 
 
 
430 aa  195  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31.07 
 
 
436 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.69 
 
 
431 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 
454 aa  194  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 
454 aa  193  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 
454 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  36.7 
 
 
349 aa  193  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 
454 aa  193  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  33.73 
 
 
433 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.09 
 
 
479 aa  193  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  31.33 
 
 
433 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 
468 aa  193  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.7 
 
 
432 aa  193  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 
454 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  33.73 
 
 
433 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  33.73 
 
 
433 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.07 
 
 
478 aa  193  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  33.96 
 
 
440 aa  191  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.08 
 
 
431 aa  191  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.64 
 
 
433 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
452 aa  191  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  30.42 
 
 
390 aa  191  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  31.97 
 
 
461 aa  190  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>