More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2728 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  99.49 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  99.49 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  99.49 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  99.49 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  97.95 
 
 		 195 aa  362  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  97.95 
 
 		 195 aa  361  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  86.67 
 
 		 192 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 206 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 206 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 221 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  57.29 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 224 aa  204  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.93 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  43.26 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  42.93 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  41.62 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.43 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  25.73 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  24.18 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  24.18 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  24.18 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  32.14 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.5 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  24.18 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  23.76 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  24.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  27.89 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.17 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  29.12 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  28.98 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.88 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  30.05 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  23.63 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>