More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0440 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0909  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0440  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1440  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0722  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.452485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
234 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  99.57 
 
 
234 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
234 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  93.59 
 
 
234 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1297  ABC transporter related  68.38 
 
 
234 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1395  ABC transporter related  67.95 
 
 
234 aa  287  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.858988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0935  ABC transporter related  67.09 
 
 
234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1417  ABC transporter related  67.09 
 
 
234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4561  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  67.52 
 
 
234 aa  277  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474601  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1336  ABC transporter related  69.23 
 
 
234 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1898  ABC transporter related  65.38 
 
 
234 aa  274  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  56.96 
 
 
237 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.54 
 
 
237 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  56.12 
 
 
237 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  48.09 
 
 
239 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  49.79 
 
 
239 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  47.66 
 
 
239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  48.71 
 
 
231 aa  207  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 
237 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  48.28 
 
 
231 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  47.64 
 
 
237 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  48.71 
 
 
231 aa  204  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  48.28 
 
 
231 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  47.66 
 
 
235 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  46.98 
 
 
231 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  46.98 
 
 
231 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  45.26 
 
 
232 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  45.11 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  45.26 
 
 
231 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  46.55 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  44.83 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  48.51 
 
 
236 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
238 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 
235 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  46.12 
 
 
231 aa  191  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  46.98 
 
 
231 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.49 
 
 
241 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  44.68 
 
 
237 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  44.68 
 
 
237 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  48.61 
 
 
230 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  45.22 
 
 
243 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  46.58 
 
 
233 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.02 
 
 
233 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  44.44 
 
 
233 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  46.15 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  46.15 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.03 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  41.03 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  43.46 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
234 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  46.03 
 
 
237 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  39.83 
 
 
231 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  43.59 
 
 
234 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  44.69 
 
 
236 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  46.05 
 
 
241 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  43.78 
 
 
230 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3479  ABC transporter related  42.26 
 
 
238 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  40 
 
 
235 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  45.41 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  39.06 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  43.05 
 
 
823 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2553  ABC transporter related  43.5 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  42.74 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  40.44 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  40.43 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3187  ABC transporter related  41.84 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.752623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3016  ABC transporter related  41.05 
 
 
237 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  43.59 
 
 
236 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  41.77 
 
 
238 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.6 
 
 
823 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  43.44 
 
 
235 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0565  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.63 
 
 
234 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000171759  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  41.45 
 
 
234 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  43.36 
 
 
244 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.53 
 
 
236 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  40.17 
 
 
234 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  40.17 
 
 
234 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  42.27 
 
 
235 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
232 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  39.66 
 
 
229 aa  158  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4221  ABC transporter related  40.08 
 
 
241 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  43.69 
 
 
238 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  45.34 
 
 
739 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  38.89 
 
 
231 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  38.43 
 
 
237 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  40.97 
 
 
238 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  44.02 
 
 
940 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  39.37 
 
 
243 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2420  ABC transporter related  39.65 
 
 
242 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4299  ABC transporter related  41.44 
 
 
240 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0652  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
238 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.795922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  42.53 
 
 
238 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>