More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0565 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0565  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000171759  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  41.3 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  41.99 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  41.84 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  42.06 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  40 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.59 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3101  ABC transporter related protein  42.02 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  41.95 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.2 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  181  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  39.48 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41.45 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  40.34 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  41.7 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.7 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.99 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.32 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.03 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  41.77 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  41.28 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  43.75 
 
 		 502 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  40.43 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.34 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  40.09 
 
 		 286 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  41.01 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  41.56 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  40.85 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  39.08 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  38.66 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 247 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  39.06 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  44.44 
 
 		 494 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  40.85 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  40.85 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  43.81 
 
 		 501 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  39.17 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.98 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  38.36 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4379  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.17 
 
 		 257 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7077  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  42.49 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  40.17 
 
 		 251 aa  175  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  41.28 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  39.15 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  39.15 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  41.1 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  38.46 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  43.3 
 
 		 502 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  38.17 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  42.59 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  41.45 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  40.34 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  39.5 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  39.33 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  40.93 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  37.87 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  38.36 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  41.7 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  41.53 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  40.25 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  38.4 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  42.73 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  41.53 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  38.3 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  39.32 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  40.74 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3977  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  decreased coverage  0.00201124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  39.82 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  38.89 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3657  ABC transporter related  39.57 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>