More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0835 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 452 aa  897    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  42.44 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  34.33 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 477 aa  196  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.17 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.67 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  30.45 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.18 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.25 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.05 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.84 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  29.77 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.93 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 451 aa  144  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 442 aa  142  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.68 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  25.11 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  25.11 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 445 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.78 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  24.66 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.1 
 
 		 496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 501 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  26.91 
 
 		 496 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 453 aa  123  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.03 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  22.74 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 515 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 520 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 517 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 515 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  28.06 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 458 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.54 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>