More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6096 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  82.07 
 
 		 311 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  81.38 
 
 		 300 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  81.03 
 
 		 308 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  79.31 
 
 		 318 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  76.85 
 
 		 298 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  74.92 
 
 		 299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  65.26 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  59.17 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  57.54 
 
 		 290 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  58.09 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  50 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  51.86 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  49.36 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  49.17 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  50.35 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  52.43 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  50.85 
 
 		 293 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  46.74 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  47.72 
 
 		 281 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  44.4 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  46.13 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  44.44 
 
 		 340 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  43.86 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  45.2 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  45.19 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  39.21 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  42.91 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  38.99 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  42.18 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  45.39 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  41.24 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  44.44 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  42.53 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  44.19 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  46.57 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  44.19 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  42.96 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  43.02 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  40.54 
 
 		 283 aa  225  9e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  43.25 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  40.07 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  41.32 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  40.53 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  40.53 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  41.26 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  39.3 
 
 		 284 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  40.14 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  43.96 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  40.32 
 
 		 282 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  43.26 
 
 		 293 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  40.85 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  43.87 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  46.08 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  44.64 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  44.32 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  37.67 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  41.75 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.55 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  36.33 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  40.37 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  43.56 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  40.14 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  39.78 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  36.49 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  41.07 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  41.07 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  39.27 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  41.07 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  36.08 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  34.33 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  41.22 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  36.24 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  40.86 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3718  FtsH protease regulator HflC  35.98 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0820553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3795  FtsH protease regulator HflC  34.97 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  40.14 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3650  FtsH protease regulator HflC  34.97 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0696  FtsH protease regulator HflC  34.97 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3916  FtsH protease regulator HflC  35.37 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  38.14 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1980  hflC protein  39.34 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  36.96 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  40.38 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  37.36 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  38.93 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0434  FtsH protease regulator HflC  35.08 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476328  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04042  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.040502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3818  HflC protein  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4706  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5691  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4733  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3838  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4646  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04004  hypothetical protein  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  36.3 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  40.5 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4417  FtsH protease regulator HflC  34.71 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  36.04 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  37.5 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>