More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4146 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  74.4 
 
 		 662 aa  961    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 664 aa  1310    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  49.75 
 
 		 659 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  45.88 
 
 		 649 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.81 
 
 		 645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.92 
 
 		 639 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  46.08 
 
 		 661 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.32 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.16 
 
 		 625 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  39.08 
 
 		 678 aa  307  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  35.33 
 
 		 619 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  36.1 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.95 
 
 		 563 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.55 
 
 		 608 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  30.09 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.94 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.94 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.94 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.94 
 
 		 507 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  35.65 
 
 		 689 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  35.51 
 
 		 540 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.09 
 
 		 643 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  32.83 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  29.83 
 
 		 580 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.48 
 
 		 585 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.2 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  29.3 
 
 		 599 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  32.26 
 
 		 689 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  34.51 
 
 		 826 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  26.54 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  29.04 
 
 		 608 aa  150  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  32.12 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  34.77 
 
 		 570 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.38 
 
 		 606 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  28.08 
 
 		 630 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  26.82 
 
 		 627 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.44 
 
 		 606 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.64 
 
 		 604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.42 
 
 		 590 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.12 
 
 		 512 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  27.9 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  33.61 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  32.67 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.09 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 482 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  25.3 
 
 		 640 aa  114  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.71 
 
 		 491 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  33.65 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.82 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25.87 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  24.48 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.19 
 
 		 495 aa  107  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  30.64 
 
 		 489 aa  107  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  28.41 
 
 		 972 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 491 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 491 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 491 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27.22 
 
 		 597 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  23.97 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 480 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.97 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.56 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.61 
 
 		 476 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  23.94 
 
 		 619 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  25.14 
 
 		 615 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 489 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  26.71 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.64 
 
 		 635 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 		 642 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  25.52 
 
 		 647 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  26.75 
 
 		 634 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.04 
 
 		 504 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.65 
 
 		 639 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  31.64 
 
 		 491 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  26.05 
 
 		 557 aa  99.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.61 
 
 		 472 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  23.62 
 
 		 574 aa  98.2  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 		 481 aa  97.8  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 470 aa  97.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  25.68 
 
 		 689 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  26.51 
 
 		 557 aa  96.3  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  23.27 
 
 		 600 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 600 aa  95.9  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 		 547 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  28.07 
 
 		 605 aa  95.1  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 487 aa  94.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 485 aa  94.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.85 
 
 		 535 aa  94.4  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  25.66 
 
 		 647 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  30.95 
 
 		 590 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  25.89 
 
 		 619 aa  94  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.35 
 
 		 489 aa  94  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>