114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1209 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  920    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  68.9 
 
 
491 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  31.32 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  34.25 
 
 
415 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  31.39 
 
 
463 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.93 
 
 
432 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  33.68 
 
 
564 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  34.01 
 
 
405 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  30.6 
 
 
431 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  37.25 
 
 
422 aa  143  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  27.75 
 
 
423 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  31.67 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  31.05 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  30.94 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  34.07 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  27.79 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  30.18 
 
 
453 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  29.74 
 
 
439 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 
422 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  27.13 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  29.43 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  28.21 
 
 
452 aa  84  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.44 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.97 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.94 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.4 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  34.55 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  32.54 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  30.97 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  31.09 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  32.14 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33.99 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  27.98 
 
 
387 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  26.98 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.46 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  22.5 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  26.83 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  31.07 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.33 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  28.96 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  30.29 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  26.86 
 
 
442 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  28.32 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  31.65 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.06 
 
 
382 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 
552 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
375 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.65 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  25.85 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.22 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  21.97 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  25.36 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.25 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  30.08 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.38 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  25.91 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.73 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  19.42 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  24.68 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  22.84 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.84 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.14 
 
 
384 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  31.3 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  31.65 
 
 
473 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  26.47 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  28.97 
 
 
432 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  32.34 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  24.66 
 
 
451 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  26.52 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  27.6 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.38 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  27.07 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.38 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.41 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  28.4 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.78 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  31.85 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 
325 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  22.55 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  50 
 
 
391 aa  47  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  25.18 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  28.43 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  26.37 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  31.94 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  30.56 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  20.76 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  21.19 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  24.28 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  31.06 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>