More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0766 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  54.69 
 
 		 616 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  57.81 
 
 		 619 aa  733    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  100 
 
 		 621 aa  1256    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  43 
 
 		 612 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  43.25 
 
 		 609 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  37.36 
 
 		 613 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  37.46 
 
 		 610 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  36.59 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  36.77 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  36.77 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  36.59 
 
 		 630 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  36.77 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  36.77 
 
 		 608 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  36.59 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  36.77 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  37.46 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  37.46 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  37.46 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  37.46 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  37.46 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  37.46 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  38.42 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  37.3 
 
 		 610 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  36.29 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  37.14 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  38.91 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  38.91 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  38.1 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  35.77 
 
 		 610 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  35.81 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  36.08 
 
 		 611 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  37.96 
 
 		 610 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  37.8 
 
 		 610 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  34.69 
 
 		 610 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  37.27 
 
 		 609 aa  353  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  34.53 
 
 		 619 aa  350  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  35.18 
 
 		 609 aa  342  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  36.5 
 
 		 545 aa  320  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  33.06 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  32.11 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  33.66 
 
 		 627 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.61 
 
 		 588 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  32.91 
 
 		 600 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.79 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.22 
 
 		 597 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.05 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.55 
 
 		 594 aa  265  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  30.47 
 
 		 604 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31 
 
 		 593 aa  257  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.29 
 
 		 604 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  31.4 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.69 
 
 		 596 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  26.87 
 
 		 602 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.69 
 
 		 596 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.11 
 
 		 596 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 		 613 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.14 
 
 		 593 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 592 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 		 605 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.27 
 
 		 624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.43 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.45 
 
 		 623 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.23 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.24 
 
 		 608 aa  241  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 		 592 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.06 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.19 
 
 		 616 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.71 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.9 
 
 		 632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  29.36 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.35 
 
 		 601 aa  234  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  26.95 
 
 		 622 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.91 
 
 		 606 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.24 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.84 
 
 		 588 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.68 
 
 		 581 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.73 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  30.47 
 
 		 605 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.05 
 
 		 592 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.5 
 
 		 592 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.71 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.29 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.19 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  28.71 
 
 		 595 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.21 
 
 		 605 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.04 
 
 		 605 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 		 605 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 588 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.55 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  26.5 
 
 		 599 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.19 
 
 		 596 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.8 
 
 		 593 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.87 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.78 
 
 		 608 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  28.59 
 
 		 620 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 591 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.37 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 590 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>