89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6181 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  50.07 
 
 		 724 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  52.25 
 
 		 715 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  75.88 
 
 		 724 aa  1027    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  64.57 
 
 		 730 aa  831    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  55.45 
 
 		 721 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  57.71 
 
 		 727 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  55.38 
 
 		 704 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  54.74 
 
 		 718 aa  715    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  58.19 
 
 		 747 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  50.49 
 
 		 740 aa  657    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  52.43 
 
 		 747 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 707 aa  1400    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  57.84 
 
 		 726 aa  734    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  58.36 
 
 		 733 aa  710    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  49.06 
 
 		 735 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  43.43 
 
 		 768 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.42 
 
 		 700 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  45.23 
 
 		 723 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 708 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  41.12 
 
 		 708 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  38.31 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  38.31 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  38.31 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  42.21 
 
 		 709 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  40.41 
 
 		 707 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  39.14 
 
 		 714 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  41.55 
 
 		 709 aa  485  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  39.74 
 
 		 714 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  41.29 
 
 		 722 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.08 
 
 		 718 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  40.76 
 
 		 728 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  39.03 
 
 		 736 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  39.03 
 
 		 723 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  42.04 
 
 		 701 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  36.96 
 
 		 733 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.71 
 
 		 719 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.61 
 
 		 699 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.38 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  32.9 
 
 		 729 aa  311  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  34.02 
 
 		 739 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  30.6 
 
 		 729 aa  301  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  32.33 
 
 		 733 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  35.59 
 
 		 722 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  29.99 
 
 		 726 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  29.49 
 
 		 734 aa  282  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  28.91 
 
 		 730 aa  280  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  34.17 
 
 		 729 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  36.89 
 
 		 699 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  32.16 
 
 		 726 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  37.86 
 
 		 701 aa  273  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  34.17 
 
 		 740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  32.38 
 
 		 774 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  32.39 
 
 		 713 aa  266  8.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.14 
 
 		 729 aa  266  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  36.32 
 
 		 713 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  33.45 
 
 		 734 aa  263  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.32 
 
 		 743 aa  262  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  30.62 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  33.48 
 
 		 818 aa  259  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  32.3 
 
 		 750 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  36.02 
 
 		 716 aa  211  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  27.26 
 
 		 730 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  32.07 
 
 		 727 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  30.71 
 
 		 726 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  29.69 
 
 		 657 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  32.49 
 
 		 530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  31.79 
 
 		 684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.09 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.85 
 
 		 732 aa  98.6  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  26.35 
 
 		 674 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  28.48 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  25.86 
 
 		 675 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  23.86 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  25.55 
 
 		 669 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  25.89 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  23.84 
 
 		 679 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  23.53 
 
 		 579 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  27.35 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  30.91 
 
 		 484 aa  55.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  28.26 
 
 		 589 aa  51.6  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.34 
 
 		 578 aa  51.2  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  27.12 
 
 		 429 aa  50.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  26.28 
 
 		 824 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.98 
 
 		 505 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  25.23 
 
 		 579 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  30.38 
 
 		 782 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  29.9 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  31.03 
 
 		 541 aa  44.3  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.08 
 
 		 684 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>