80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4461 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  353  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  46.52 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  47.94 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  40.76 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  39.58 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  36.11 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  35 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  35 
 
 		 182 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  39.36 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  37.27 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  40.64 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  38.64 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 263 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  42.37 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 319 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  29.09 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  42.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  55.81 
 
 		 310 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 259 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 200 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 222 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 208 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 248 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 250 aa  41.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 295 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>