77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1979 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 542 aa  1116    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  62.5 
 
 		 551 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  56.96 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  51.73 
 
 		 553 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  47.93 
 
 		 553 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  46.49 
 
 		 552 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  46.57 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  44.6 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.34 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.81 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.42 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  34.9 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  32.03 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 558 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 505 aa  94.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 544 aa  87  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.63 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  23.74 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 450 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.18 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.09 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 556 aa  54.7  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 522 aa  53.9  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 573 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 585 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.04 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.53 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 537 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 547 aa  47.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 998 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 453 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.54 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.1 
 
 		 422 aa  44.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.57 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.57 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.61 
 
 		 511 aa  43.5  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 537 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 571 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>