231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0817 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 350 aa  718    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  45.14 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  44.98 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 351 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 416 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  44.24 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  41.94 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  42.59 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 343 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.75 
 
 		 273 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  45 
 
 		 269 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  45.56 
 
 		 271 aa  215  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  44.61 
 
 		 276 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  43.87 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  43.49 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  42.96 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  42.96 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  44.19 
 
 		 290 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 273 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  43.87 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  37.13 
 
 		 274 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  40.79 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  41.89 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  41.88 
 
 		 280 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  36.92 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  40.81 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  38.6 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  41.15 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  41.09 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  38.06 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  37.17 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  27.76 
 
 		 274 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  27.31 
 
 		 248 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  28.63 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  27.04 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  25.66 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  26.01 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  26.47 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  27.55 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  24.44 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  27.42 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  26.89 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  25.91 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  23.53 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  24.72 
 
 		 244 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  28.25 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  25.36 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  28.11 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  27.72 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  23.11 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  25.47 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  25.3 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  27.12 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  25.3 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  26.27 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.99 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  24.9 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  27.11 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  24.9 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  25.82 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.51 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  24.09 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  24.7 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  24.9 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  23.53 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  23.51 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  22.91 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  22.39 
 
 		 257 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  22.99 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  25.33 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  24.82 
 
 		 252 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  25 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  24.46 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  25.1 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  25.42 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  26.88 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.17 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  26.27 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  24.22 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  25.86 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  21.58 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  22.96 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  26.29 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  22.75 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  26.32 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  24.9 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  25.51 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  26.3 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.64 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>