More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3110 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  89.62 
 
 
440 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  89.16 
 
 
440 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  100 
 
 
443 aa  831    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  64.66 
 
 
508 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  32.8 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  32.43 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  32.43 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  36.96 
 
 
454 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  36.74 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  36.11 
 
 
454 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  30.88 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2238  outer membrane efflux protein  31.32 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  32.68 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  26.99 
 
 
504 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 
498 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  32.2 
 
 
477 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  32.43 
 
 
477 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1709  outer membrane efflux protein  31.27 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.72 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1636  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.17 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  30.81 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.19 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.94 
 
 
576 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  29.01 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.57 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 
523 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
731 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.84 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  29.89 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  26.01 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  29.18 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  30.27 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.71 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.07 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  26.81 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.07 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1022  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.9 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.97 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.9 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.96 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  26.27 
 
 
453 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.97 
 
 
523 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.79 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2066  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.25 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  31.07 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.04 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  24.14 
 
 
577 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.72 
 
 
537 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.24 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.34 
 
 
495 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.27 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.67 
 
 
495 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.81 
 
 
590 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.41 
 
 
486 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  23.59 
 
 
512 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.09 
 
 
471 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  28.1 
 
 
470 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 
437 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.69 
 
 
493 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  27.23 
 
 
496 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
438 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.31 
 
 
491 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.97 
 
 
496 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.97 
 
 
496 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.3 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.56 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  28.1 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0952  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.7 
 
 
634 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  30.7 
 
 
634 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  30.31 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.7 
 
 
634 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  25.59 
 
 
508 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  27.31 
 
 
457 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.55 
 
 
496 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.57 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2105  Outer membrane protein  30.7 
 
 
574 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.59 
 
 
477 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 
467 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
627 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.85 
 
 
485 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 
525 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  25.6 
 
 
498 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  25.33 
 
 
506 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  25.33 
 
 
508 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25 
 
 
497 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>