More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1393 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
336 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3222  secretion protein HlyD  54.38 
 
 
328 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  56.06 
 
 
333 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4301  secretion protein HlyD  57.53 
 
 
335 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4200  secretion protein HlyD  54.17 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.86 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  47.45 
 
 
338 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0242  RND family efflux transporter MFP subunit  48.49 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  45.15 
 
 
319 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2287  RND family efflux transporter MFP subunit  45.51 
 
 
332 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0461  multidrug/cation efflux pump  45.97 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2114  RND family efflux transporter MFP subunit  45.97 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2474  RND family efflux transporter MFP subunit  38.66 
 
 
344 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  42.33 
 
 
332 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.469854  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 
415 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  32.72 
 
 
413 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
415 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
415 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
415 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
415 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  31.03 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  30.46 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  30.46 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  30.46 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  30.46 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  30.46 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  29.89 
 
 
413 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  30.72 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  30.86 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.52 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.97 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.04 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  30.97 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.39 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.13 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.97 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  29.23 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  27.18 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  36.3 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  26.32 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  30.65 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  27.2 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 
388 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4376  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.349604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.9 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.9 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0257934  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  29.88 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  28.12 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  30.93 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.54 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  24.92 
 
 
357 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  29.65 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  23.28 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.9 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  27.57 
 
 
388 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  29.87 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  26.26 
 
 
388 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 
351 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.9 
 
 
385 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>