99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4601 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4601  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
398 aa  823    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
1276 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
878 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
627 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
458 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
900 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
593 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.09 
 
 
267 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.07 
 
 
1056 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
265 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
244 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 
1022 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.02 
 
 
818 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
249 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34 
 
 
988 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
249 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
615 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
289 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1069 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.85 
 
 
676 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
217 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0712  hypothetical protein  35 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
194 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
3560 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
750 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
199 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
927 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
784 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
565 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
3301 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  28.91 
 
 
656 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
4079 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0770  hypothetical protein  26.02 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
448 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 
931 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.83 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.39 
 
 
1056 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
871 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.69 
 
 
875 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
1827 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
213 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
199 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.91 
 
 
545 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
4489 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 
641 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 
632 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  29.82 
 
 
252 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
374 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 
1213 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  36.92 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
747 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  25.27 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  24.19 
 
 
329 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  31.43 
 
 
584 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
292 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  32.63 
 
 
1133 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
847 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
824 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  26.74 
 
 
545 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.62 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  35.48 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
240 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
515 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.72 
 
 
2401 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 
519 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
3145 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0025  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.76 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.33 
 
 
884 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 
624 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 
283 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.71 
 
 
681 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
265 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
286 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 
1056 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.07 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
280 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
1737 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  29.59 
 
 
643 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
172 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
1061 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
890 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 
248 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>