More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0217 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  100 
 
 
583 aa  1197    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.01 
 
 
553 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
554 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.68 
 
 
554 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.82 
 
 
517 aa  203  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.51 
 
 
545 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  31.03 
 
 
528 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.04 
 
 
548 aa  200  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
548 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.54 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.17 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.81 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.87 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.65 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.2 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.28 
 
 
531 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.49 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.94 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.93 
 
 
555 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  30.68 
 
 
542 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.08 
 
 
548 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  31.42 
 
 
540 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.6 
 
 
542 aa  193  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  193  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 
548 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.96 
 
 
528 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.08 
 
 
548 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 
558 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 
558 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 
558 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 
558 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.71 
 
 
530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.31 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.59 
 
 
544 aa  191  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.26 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 
558 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 
558 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.08 
 
 
558 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  30.13 
 
 
531 aa  190  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.85 
 
 
530 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.29 
 
 
532 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 
557 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.6 
 
 
543 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.97 
 
 
548 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  29.61 
 
 
536 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 
546 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 
546 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.81 
 
 
552 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.93 
 
 
546 aa  187  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.63 
 
 
526 aa  187  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  31.29 
 
 
537 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.2 
 
 
557 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  28.6 
 
 
604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 
552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.3 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  30.06 
 
 
559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
553 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.97 
 
 
554 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  27.62 
 
 
531 aa  183  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
553 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.97 
 
 
554 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
552 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
552 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.39 
 
 
555 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  30.98 
 
 
536 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  27.37 
 
 
547 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.65 
 
 
575 aa  180  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.7 
 
 
541 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  27.79 
 
 
570 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.08 
 
 
530 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.59 
 
 
536 aa  176  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  38.74 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  29.94 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.02 
 
 
557 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.18 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  28.01 
 
 
584 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  29.2 
 
 
551 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  29.87 
 
 
548 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.02 
 
 
536 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.57 
 
 
567 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  30.14 
 
 
534 aa  171  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.88 
 
 
563 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  28.19 
 
 
585 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.69 
 
 
578 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  32.63 
 
 
562 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
581 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  26.97 
 
 
583 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  30.67 
 
 
534 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.7 
 
 
541 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.69 
 
 
578 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4043  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.75 
 
 
571 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.695659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  27.54 
 
 
565 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  36.78 
 
 
552 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  26.99 
 
 
579 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.15 
 
 
560 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>