More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0507 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 437 aa  894    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  41.33 
 
 		 467 aa  299  9e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  38.63 
 
 		 642 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  37.38 
 
 		 507 aa  265  8e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  37.38 
 
 		 497 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  37.89 
 
 		 454 aa  259  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  39.01 
 
 		 474 aa  256  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  39.36 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  37.14 
 
 		 482 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  37.14 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.29 
 
 		 492 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  36.67 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  34.76 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  36.71 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  38.28 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  36.47 
 
 		 413 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  35.76 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  33.87 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  36.46 
 
 		 483 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  35.27 
 
 		 422 aa  223  6e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.73 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  34.1 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.88 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  33.8 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  31.41 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  27.94 
 
 		 892 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  25.25 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  30.77 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  29.74 
 
 		 1001 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.36 
 
 		 764 aa  99.8  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  32.91 
 
 		 942 aa  99.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.43 
 
 		 349 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  30.42 
 
 		 289 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.3 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  30.28 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.51 
 
 		 324 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  31.65 
 
 		 1092 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.43 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  32.39 
 
 		 319 aa  91.3  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  31.98 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.36 
 
 		 315 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  28.26 
 
 		 327 aa  86.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  28.93 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.58 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  27.84 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.79 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  30.45 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  31.17 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  27.92 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  28.93 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  26.98 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.42 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  29.71 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  27.6 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  28.67 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.04 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  29.66 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  30.77 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  32.01 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  30.93 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  29.84 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  27.64 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  31.8 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  27.37 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  31.17 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  30.24 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  25.75 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  28.92 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.05 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.47 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  32.37 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.9 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  25.55 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.8 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.69 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  22.9 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  24.15 
 
 		 993 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  25.3 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  24.78 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  27.13 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  27.16 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  28.33 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.56 
 
 		 569 aa  63.2  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.91 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.57 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  27.51 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  33.81 
 
 		 940 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  24.73 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  26.69 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.27 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.04 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  25.91 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  25.69 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  27.2 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  26.98 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  25.56 
 
 		 1015 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>