More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4753 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  89.84 
 
 
259 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  87.26 
 
 
259 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  80.88 
 
 
255 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  73.71 
 
 
255 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  73.31 
 
 
255 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.31 
 
 
255 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  73.71 
 
 
255 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  73.71 
 
 
255 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  71.88 
 
 
256 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  71.88 
 
 
256 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  71.48 
 
 
255 aa  352  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  58.61 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  58.2 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 
250 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  58.75 
 
 
255 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  59.11 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  52.63 
 
 
253 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.35 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  42.39 
 
 
250 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  45.75 
 
 
252 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  45.68 
 
 
253 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  45.27 
 
 
253 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  41.2 
 
 
250 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.44 
 
 
233 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
255 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  42.4 
 
 
255 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  40.24 
 
 
250 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.34 
 
 
250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.09 
 
 
246 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  39.92 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  39.59 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  39.75 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  39.37 
 
 
257 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  43.44 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
271 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
255 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.44 
 
 
233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40 
 
 
253 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
251 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  38.52 
 
 
251 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.34 
 
 
263 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  41.53 
 
 
249 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 
257 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  42.8 
 
 
251 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  44.49 
 
 
246 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.53 
 
 
250 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.82 
 
 
250 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  38.93 
 
 
263 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
259 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  39.34 
 
 
259 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  38.89 
 
 
258 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  40.87 
 
 
252 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.24 
 
 
250 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.93 
 
 
259 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  38.78 
 
 
258 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  42.86 
 
 
260 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  39.27 
 
 
256 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  39.27 
 
 
256 aa  184  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.44 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  38.93 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  41.57 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  38.52 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  38.93 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  38.52 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  38.93 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  43.44 
 
 
249 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  38.06 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  37.55 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
249 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 
256 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  40.41 
 
 
251 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  38.78 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  38.74 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
255 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  37.55 
 
 
256 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  37.3 
 
 
256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  38 
 
 
255 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.93 
 
 
256 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  38.93 
 
 
252 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  37.14 
 
 
256 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  38.52 
 
 
259 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  42.21 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  38.11 
 
 
256 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  36.48 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  38.31 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  38.31 
 
 
256 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  37.45 
 
 
278 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.49 
 
 
244 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.133556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>