More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13791 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  96.05 
 
 
380 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
380 aa  763    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  91.84 
 
 
379 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  96.58 
 
 
380 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  75.92 
 
 
382 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  75.65 
 
 
382 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.63 
 
 
380 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  73.58 
 
 
383 aa  587  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.24 
 
 
376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.11 
 
 
377 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.87 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.4 
 
 
381 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
379 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.28 
 
 
379 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  52.49 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.96 
 
 
382 aa  411  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.44 
 
 
380 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.85 
 
 
396 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.59 
 
 
544 aa  99  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  40 
 
 
553 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  36.36 
 
 
225 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.37 
 
 
787 aa  89  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.68 
 
 
533 aa  88.6  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  35.96 
 
 
628 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  38.53 
 
 
257 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 
526 aa  87.4  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.5 
 
 
554 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  40.95 
 
 
539 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  34.51 
 
 
584 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.5 
 
 
554 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  38.39 
 
 
584 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  37.4 
 
 
268 aa  86.3  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.67 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.52 
 
 
607 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  42.16 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
555 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  38.1 
 
 
548 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  38.39 
 
 
587 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.25 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  40.37 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 
610 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  37.25 
 
 
257 aa  84  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  40.52 
 
 
592 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  36.61 
 
 
583 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.29 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.89 
 
 
559 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  36 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  36.61 
 
 
583 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  40.32 
 
 
557 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  38.53 
 
 
607 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  48.04 
 
 
213 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.32 
 
 
621 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  37.72 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.93 
 
 
530 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  39.29 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.93 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  35 
 
 
536 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  38.57 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.2 
 
 
582 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  36.28 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  36.04 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  34.04 
 
 
536 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.93 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
578 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  36.52 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.84 
 
 
596 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  40.4 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.84 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  38.89 
 
 
552 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
557 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.59 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  40.16 
 
 
556 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  36.28 
 
 
585 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.02 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 
565 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.13 
 
 
544 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.1 
 
 
565 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  37.67 
 
 
534 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.89 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.07 
 
 
609 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1710  60 kDa inner membrane insertion protein  39.45 
 
 
699 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.84 
 
 
595 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>