228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2690 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2690  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
308 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1266  TPR repeat-containing protein  90.85 
 
 
307 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2597  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  96.1 
 
 
308 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2503  TPR repeat-containing protein  59.26 
 
 
409 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151754 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.24 
 
 
816 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
789 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.72 
 
 
706 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.2 
 
 
620 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
620 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.43 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
878 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.1 
 
 
810 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.9 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.9 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
3145 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
909 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
632 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 
1022 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.31 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
708 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.6 
 
 
1056 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
750 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 
1067 aa  62.4  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 
626 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 
614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
927 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
614 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.75 
 
 
626 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
465 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
614 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.01 
 
 
730 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
612 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
639 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 
1154 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2572  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
366 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
739 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.08 
 
 
1013 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
847 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
636 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 
689 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.64 
 
 
725 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
828 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
637 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 
875 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
718 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
1421 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
3172 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.63 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
828 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.93 
 
 
764 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1450 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32.04 
 
 
780 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.92 
 
 
706 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.98 
 
 
784 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
828 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
556 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  33.87 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
1486 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.29 
 
 
648 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 
1056 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
1276 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
635 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
635 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
611 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 
639 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 
818 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
637 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
697 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.72 
 
 
622 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
3035 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.09 
 
 
603 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
486 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.18 
 
 
661 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.76 
 
 
676 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
3560 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
1406 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
634 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
750 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  33.67 
 
 
708 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
681 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.27 
 
 
865 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 
697 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.53 
 
 
561 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>