186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0261 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0261  type II secretion system protein F domain  100 
 
 		 291 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000564215  hitchhiker  0.000000175169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0598  type II secretion system protein F domain  99.31 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0681  type II secretion system protein  96.22 
 
 		 291 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  38.98 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  31.92 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  35.61 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  29.05 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.97 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 325 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  23.53 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  21.07 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  27.44 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  26 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  24.19 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  25.5 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.68 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  20.79 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  23.46 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.02 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  22.86 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  21.8 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  22.35 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  23.12 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  22.43 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  22.02 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.91 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  25.15 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  20.92 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  20.22 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  20.97 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 535 aa  69.3  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.02 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.84 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.14 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  21.83 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  23.24 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  24 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  23.04 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  24.02 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>