More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0208 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 458 aa  952    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  56.27 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  54.22 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  54.96 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 		 419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  50.84 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  52.45 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  51.11 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  52.69 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  50.86 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  53.45 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  50.86 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  51.42 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  45.22 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 458 aa  86.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.96 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.06 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.32 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.4 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.63 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.87 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.94 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.2 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  24.92 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  28.78 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.78 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  28.78 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.11 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.24 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.05 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  20.06 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.63 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>