More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1486 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  991    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  35.91 
 
 		 506 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.7 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 554 aa  210  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  32.58 
 
 		 542 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.93 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  33.75 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  30.67 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.86 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 590 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.03 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.89 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.48 
 
 		 561 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  29.07 
 
 		 542 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.93 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.84 
 
 		 555 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  28.36 
 
 		 542 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 549 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.09 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  29.95 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.98 
 
 		 541 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.67 
 
 		 578 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  25.88 
 
 		 518 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.95 
 
 		 597 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.35 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 576 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.37 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.24 
 
 		 662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.19 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.05 
 
 		 569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.95 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  23.71 
 
 		 601 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  30.9 
 
 		 252 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  23.71 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.39 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  27.12 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.97 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.57 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  30.77 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.29 
 
 		 562 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 564 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.49 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.51 
 
 		 665 aa  123  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.2 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.38 
 
 		 565 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.01 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.15 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.3 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  28.91 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.13 
 
 		 549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 546 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  29.51 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  34.76 
 
 		 211 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.69 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.82 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.96 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.4 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.96 
 
 		 550 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.1 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  24.52 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.9 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.09 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  29.45 
 
 		 558 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.09 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.15 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.6 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  28.69 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.13 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.47 
 
 		 534 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.84 
 
 		 553 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 511 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.39 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  28.3 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.54 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.01 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 		 580 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  30.27 
 
 		 743 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.94 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.68 
 
 		 541 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.1 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.67 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  26.59 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>