More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2787 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  73.49 
 
 		 440 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  79.45 
 
 		 440 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  882    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  70.3 
 
 		 432 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  69.93 
 
 		 435 aa  614  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  66.9 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  66.12 
 
 		 452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  64.97 
 
 		 434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  64 
 
 		 442 aa  554  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  62.59 
 
 		 442 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  63.34 
 
 		 442 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  62.21 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  63.57 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  60.84 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  61.11 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  60.19 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  61.41 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  59.67 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  60.37 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  59.63 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  62.07 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  56.57 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  58.89 
 
 		 444 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  57.51 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  54.93 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  58.89 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58 
 
 		 445 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  58.89 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.21 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  55.79 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  54.04 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  57.57 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  54.92 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  58.25 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  54.12 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  57.08 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.63 
 
 		 439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  52.8 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  51.63 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  51.65 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  49.32 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  50.22 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  32.79 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.64 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  31.66 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.48 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  35.53 
 
 		 497 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  30.05 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.13 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.05 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  31.44 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.86 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  29.09 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.26 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  31.69 
 
 		 549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.68 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  29.7 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  29.61 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  30.95 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.92 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.43 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.52 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.46 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.93 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  31.03 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.25 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  27.89 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.87 
 
 		 507 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.87 
 
 		 507 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  29.36 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.78 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.29 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.52 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.61 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.12 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.04 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.26 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  25.97 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.78 
 
 		 440 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  27.34 
 
 		 483 aa  106  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 		 393 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  23.72 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.72 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  28.49 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.03 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.29 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.15 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  27.3 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  31.85 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  26.77 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  27.82 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  31.51 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.59 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.29 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  31.45 
 
 		 396 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  28.88 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  23.87 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>