More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0341 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  100 
 
 		 318 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  80.91 
 
 		 315 aa  507  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  77.02 
 
 		 313 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  72.67 
 
 		 313 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  73.46 
 
 		 312 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  68.81 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  69.97 
 
 		 319 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  67.83 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  67.3 
 
 		 318 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  67.82 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  65.92 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  66.56 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  66.34 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  60.51 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  62.87 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  62.87 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  62.87 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  62.42 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  62.5 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  55.52 
 
 		 312 aa  311  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  45.19 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  43.37 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  42.09 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  42.09 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  42.09 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  42.17 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  39.87 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  43.99 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  41.67 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  42.17 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  44.01 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  44.52 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  41.56 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  40.63 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  43.49 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  39.94 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  39.48 
 
 		 327 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  36.84 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  38.87 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  38.87 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  38.87 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  41.88 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  38.87 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  37.83 
 
 		 320 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  37.58 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  37.86 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  41.76 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  43.46 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 		 363 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.52 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.78 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  34.15 
 
 		 271 aa  149  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  33.11 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  34.18 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  34.18 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.81 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  34.18 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  34.74 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  35.26 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  33.44 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.17 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  32.01 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.44 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  34.47 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.33 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.42 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.59 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  32.76 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.15 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.25 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  33.81 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  31.83 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.53 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  34.45 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  33.94 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.01 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.09 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  31.79 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.01 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  33.94 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.01 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.01 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  36.07 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  31.29 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>