143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2608 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  928    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.45 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.37 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.4 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.74 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.38 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  36.97 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.41 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  35.64 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.37 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  34.15 
 
 		 185 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.27 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  36.63 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  36.63 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  37.61 
 
 		 186 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  33.96 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  33.88 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  31.78 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.14 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  37.86 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  37.86 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.68 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  31.13 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  32.41 
 
 		 133 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  30.72 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  34.31 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  33.06 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  35 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  38 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  32.67 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  32.67 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 202 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  32.69 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  36 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  36 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 140 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 536 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  32 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  35.79 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  33.64 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  31.5 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  51.92 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  31.68 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  30 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  28.18 
 
 		 577 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.65 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  30.39 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  29.59 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  30 
 
 		 524 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 		 326 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  29 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  31 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.1 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  32.67 
 
 		 511 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  26.21 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  26.21 
 
 		 381 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  28.43 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  26.37 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  28.43 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  31.52 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  28.43 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  29 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.29 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  32 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  30 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  31.15 
 
 		 157 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  30.11 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.92 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2809  Serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0136026  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  26.32 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  36.47 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  29.21 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  29.21 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  30.21 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  27.08 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.83 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  29.25 
 
 		 77 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  32.65 
 
 		 495 aa  46.6  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  29.52 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  28.42 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  30.21 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.87 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  28.09 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  35.62 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2976  RDD domain-containing protein  34.48 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0648796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3018  RDD domain-containing protein  34.48 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.792244  normal  0.129954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  25 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.09 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0824  hypothetical protein  73.08 
 
 		 43 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  26.89 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  28.42 
 
 		 485 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  28.12 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.99 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>