99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1294 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  37.87 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  32.12 
 
 		 267 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  34.51 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  33.46 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  32.51 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1580  hypothetical protein  40.94 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.850718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1556  hypothetical protein  40.27 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  27 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  26.05 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  26.18 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  46.05 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  44.74 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  44.74 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  28.12 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  28.16 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  24.05 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  32.81 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0277  hypothetical protein  42.05 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0918994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  24.32 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  25.32 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  24.6 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1912  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000147747  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  34.41 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  24.25 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  29.05 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  44.12 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  42.65 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  34.52 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  42.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  41.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  37.7 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  41.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  24.09 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  40.91 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0458  hypothetical protein  35.56 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  36.62 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  34.44 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05211  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05141  hypothetical protein  38.96 
 
 		 163 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  22.12 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  38.57 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  22.87 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  32.47 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  39.06 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  28.06 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  40 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  32.65 
 
 		 372 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  37.68 
 
 		 510 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0955  hypothetical protein  38.03 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000127894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06601  hypothetical protein  34.07 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0624  XRE family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.582381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2004  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3558  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  24.27 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  23.53 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  29.73 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  33.8 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  22.05 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  33.8 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.71 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  24.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  24.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2234  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07520  hypothetical protein  31.88 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00214299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  34.43 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  25.19 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.35 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0933  hypothetical protein  35.21 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  30.43 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  30.86 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  20.74 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  29.49 
 
 		 687 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.88 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>