28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1122 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1411    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  48.92 
 
 		 773 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  41.11 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  35.24 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  36.14 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  32 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  31.67 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  30.14 
 
 		 280 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 249 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 270 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  30.08 
 
 		 368 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 241 aa  52.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  26.77 
 
 		 284 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 281 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  31.62 
 
 		 304 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25.29 
 
 		 258 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  24.73 
 
 		 256 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 342 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  27.17 
 
 		 266 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 345 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 287 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 267 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  34.38 
 
 		 266 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  27.08 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>