15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0397 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1577    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1122  hypothetical protein  48.92 
 
 		 687 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.477983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  36.51 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  36.05 
 
 		 252 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  35.45 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.18 
 
 		 313 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  33.75 
 
 		 314 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 345 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  30.69 
 
 		 284 aa  50.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.63 
 
 		 246 aa  47.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  32.86 
 
 		 243 aa  48.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  35.94 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 277 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  29.17 
 
 		 288 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 249 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>