More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0837 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  100 
 
 		 378 aa  766    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  98.42 
 
 		 379 aa  740    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  34.17 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  34.1 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  34.36 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  34.62 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0976  ROK family protein  37.43 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  35.83 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  32.38 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.64 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.9 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.57 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.95 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.67 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  32.66 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  31.73 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.59 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  32.1 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.92 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.4 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.05 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  31.34 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.37 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.01 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  25.32 
 
 		 410 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.57 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.72 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.03 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.01 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.98 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.98 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.49 
 
 		 416 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  31.12 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.2 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.79 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  28.61 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.27 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  27.76 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.39 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  24.93 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  27.79 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.39 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.39 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.8 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.78 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.3 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.59 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.43 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.27 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.27 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  27.3 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25.74 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  27.39 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.57 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.6 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  28.57 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.28 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  27.72 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.13 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.73 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  26.56 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  28.98 
 
 		 385 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.14 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.73 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.3 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  23.9 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.84 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  25.4 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  34.53 
 
 		 322 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.26 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  25.25 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  25.78 
 
 		 503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  26.36 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.88 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  27.86 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  25.6 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.27 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.97 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  25.72 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  24.45 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.19 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.5 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  26.41 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.35 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  30.37 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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