More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1761 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1145    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  41.73 
 
 		 635 aa  326  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  41.6 
 
 		 972 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  40.24 
 
 		 731 aa  319  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  42.3 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  38.35 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  46.8 
 
 		 627 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  37.14 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  37.82 
 
 		 574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  35.5 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 		 578 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 		 578 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  32.01 
 
 		 526 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  32.01 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  31.45 
 
 		 505 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  26.21 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  24.89 
 
 		 606 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 476 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 419 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 421 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 421 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.18 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  29.21 
 
 		 419 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.59 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 479 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 482 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 482 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 482 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 419 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.45 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 420 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 441 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.89 
 
 		 470 aa  97.8  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 471 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 426 aa  97.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  31.02 
 
 		 423 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 495 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 513 aa  92.8  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 441 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 519 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 445 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 454 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 495 aa  90.1  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.32 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.37 
 
 		 440 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 429 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 443 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 463 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 497 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 467 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.24 
 
 		 470 aa  87  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  27.02 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 514 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  27.85 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.5 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 738 aa  84  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1470 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.57 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  25.12 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  27.81 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>