250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3234 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  76.79 
 
 		 822 aa  1068    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 818 aa  1618    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  39.93 
 
 		 794 aa  356  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  34.63 
 
 		 810 aa  281  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  31 
 
 		 825 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  31.57 
 
 		 762 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.31 
 
 		 850 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  33.02 
 
 		 792 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  31.68 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 		 815 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30.89 
 
 		 743 aa  174  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 		 846 aa  171  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  28.82 
 
 		 831 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  29.29 
 
 		 763 aa  167  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  27.15 
 
 		 788 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  28.23 
 
 		 800 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  28.78 
 
 		 798 aa  151  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 		 725 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  26.83 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  27.52 
 
 		 771 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  31.31 
 
 		 790 aa  106  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  37.67 
 
 		 749 aa  101  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  35 
 
 		 720 aa  98.6  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  28.73 
 
 		 728 aa  97.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  33.51 
 
 		 812 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  25.95 
 
 		 840 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  32.29 
 
 		 730 aa  90.1  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  30.49 
 
 		 890 aa  88.6  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  30.22 
 
 		 886 aa  88.6  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  40.15 
 
 		 742 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  28.02 
 
 		 774 aa  87.8  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  40.15 
 
 		 742 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  34.81 
 
 		 742 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  25.61 
 
 		 820 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  35.15 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  37.09 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  37.09 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  40.98 
 
 		 982 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  37.09 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  37.09 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  37.09 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  38.64 
 
 		 742 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  40.16 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  36.42 
 
 		 742 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  38.02 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.29 
 
 		 859 aa  81.6  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  28.09 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  32.22 
 
 		 866 aa  80.9  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  26.83 
 
 		 775 aa  80.9  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  25.66 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  35.76 
 
 		 744 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  40.57 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  27.5 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  31.75 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.92 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  34.62 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  38.79 
 
 		 1238 aa  74.7  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  35.65 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  41.05 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  28.96 
 
 		 681 aa  73.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  40.21 
 
 		 943 aa  73.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  39.83 
 
 		 689 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  45.57 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  28.17 
 
 		 862 aa  72.4  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  35.59 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 668 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  39.22 
 
 		 673 aa  71.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  33.52 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  31.19 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  38.33 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  38.33 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3214  transglutaminase domain protein  38.94 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257235  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  29.89 
 
 		 876 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  36.59 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  35.59 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  47.14 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  42.22 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  37.96 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  37.96 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.69 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  36.21 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  41.11 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  34.56 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  38.46 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 		 645 aa  67  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  30.26 
 
 		 790 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  30.48 
 
 		 644 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 		 689 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  37.76 
 
 		 656 aa  67.4  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  36.3 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  32.62 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  37.14 
 
 		 637 aa  66.6  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  34.02 
 
 		 633 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>