More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1240 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
809 aa  1604    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.93 
 
 
729 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  53.63 
 
 
388 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  49.24 
 
 
381 aa  298  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  48.91 
 
 
374 aa  298  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  47.99 
 
 
398 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  47.76 
 
 
389 aa  290  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  46.3 
 
 
369 aa  288  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  48.64 
 
 
399 aa  287  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  47.13 
 
 
360 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  46.93 
 
 
406 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  48.58 
 
 
369 aa  280  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  47.11 
 
 
405 aa  277  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  46.01 
 
 
377 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  49.32 
 
 
343 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  46.54 
 
 
404 aa  259  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  41.05 
 
 
381 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  43.87 
 
 
335 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  43.89 
 
 
394 aa  247  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  43.56 
 
 
369 aa  244  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  42.14 
 
 
401 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  41.81 
 
 
357 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.86 
 
 
407 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  41.58 
 
 
394 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  40.06 
 
 
353 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  41.18 
 
 
388 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  40.37 
 
 
442 aa  222  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  40.18 
 
 
367 aa  217  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  36.29 
 
 
408 aa  193  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  36.28 
 
 
410 aa  188  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 
360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  39.27 
 
 
363 aa  183  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  37.17 
 
 
385 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.17 
 
 
385 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
366 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 
385 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.02 
 
 
365 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  35.04 
 
 
387 aa  157  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  33.73 
 
 
407 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.34 
 
 
390 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 
413 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 
443 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  35.24 
 
 
374 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  33.96 
 
 
412 aa  146  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 
374 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 
375 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 
391 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 
382 aa  144  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  32.93 
 
 
387 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.41 
 
 
376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  32.78 
 
 
413 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
396 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  32.71 
 
 
383 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  32.87 
 
 
530 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
394 aa  139  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 
403 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.75 
 
 
391 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  32.82 
 
 
384 aa  138  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 
410 aa  138  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 
387 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 
386 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.14 
 
 
399 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.55 
 
 
375 aa  136  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  52.5 
 
 
554 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 
387 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.84 
 
 
400 aa  135  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  53.08 
 
 
649 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  34.55 
 
 
382 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  32.02 
 
 
379 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.64 
 
 
387 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  44.12 
 
 
2170 aa  134  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  37.5 
 
 
2073 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 
408 aa  134  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  31.36 
 
 
432 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  32.06 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  33.54 
 
 
392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  32.11 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  36.24 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 
428 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  31.61 
 
 
428 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  30.75 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  38.1 
 
 
342 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  31.89 
 
 
377 aa  132  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.33 
 
 
407 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  32.52 
 
 
388 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  30.72 
 
 
400 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.45 
 
 
585 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  32.13 
 
 
377 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 
406 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  28.92 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 
397 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 
388 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 
366 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  34.07 
 
 
1029 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.85 
 
 
378 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>