More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0038 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  78.05 
 
 		 401 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  77.81 
 
 		 401 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  78.05 
 
 		 401 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 402 aa  819    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  78.05 
 
 		 401 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  81.05 
 
 		 401 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  80.3 
 
 		 401 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  80.3 
 
 		 401 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  79.6 
 
 		 402 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  60.8 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  60.55 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  59.8 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  58.79 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  58.1 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  55.92 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.37 
 
 		 426 aa  262  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.13 
 
 		 446 aa  258  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 437 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  41.1 
 
 		 439 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.4 
 
 		 432 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 438 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 438 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  37.1 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.97 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.97 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.76 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 438 aa  242  7e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.58 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  39.45 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.53 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.55 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.83 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.25 
 
 		 439 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  39.14 
 
 		 437 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  39.51 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  38.4 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.63 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.43 
 
 		 476 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  37.35 
 
 		 435 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  38.58 
 
 		 437 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  37.2 
 
 		 439 aa  235  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 445 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.57 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.57 
 
 		 444 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  37.89 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.69 
 
 		 439 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  39.29 
 
 		 451 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  38.7 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  38.7 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.39 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  35.41 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  35.41 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 		 462 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  35.31 
 
 		 515 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 458 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.39 
 
 		 419 aa  229  9e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 515 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.58 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  36.72 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>