243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5895 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 408 aa  846    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  51.47 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  38.05 
 
 		 425 aa  239  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  36.23 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  33.98 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  33 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  35.64 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  33.25 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.99 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  34.97 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  29.02 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  29.02 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  33.43 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  29.02 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  28.78 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  28.78 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  28.78 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.95 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  28.12 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  28.98 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  29.04 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  33 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  32.15 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  35.03 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  28.3 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.8 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  29.94 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.88 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  29.95 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  29.29 
 
 		 498 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.34 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.04 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  32.27 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  28.43 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  32.29 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  29.11 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  33.11 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  28.11 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  30.99 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  32.65 
 
 		 537 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  30.77 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.88 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  34.54 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  30.14 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  27.9 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  27.33 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  29.61 
 
 		 410 aa  116  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.93 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  28.25 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  28.28 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  31.07 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  30.71 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  32.23 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  32.23 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  32.2 
 
 		 381 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  29.43 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.18 
 
 		 400 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  32.23 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.52 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  31.39 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.11 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  29.47 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.82 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.15 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.03 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  33.11 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.38 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  32.81 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  33.22 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  31.51 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.79 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  27.93 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  27.42 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.78 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  29.24 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  30.1 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  23.9 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  32.75 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  31.02 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  32.55 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  27.93 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  29.32 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  29.48 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  25.47 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  27.8 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.91 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  29.3 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  27.88 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.8 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>