123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0797 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  93.61 
 
 
1393 aa  2646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  100 
 
 
1393 aa  2859    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  56.04 
 
 
1311 aa  1364    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  36.28 
 
 
887 aa  265  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  34.04 
 
 
935 aa  254  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  36.19 
 
 
730 aa  247  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  30.38 
 
 
927 aa  245  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  36.2 
 
 
730 aa  231  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  36 
 
 
730 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  33.59 
 
 
950 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  38.87 
 
 
656 aa  134  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  40.52 
 
 
3278 aa  133  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  28.72 
 
 
839 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  41.99 
 
 
902 aa  105  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  39.89 
 
 
901 aa  102  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01650  Extracellular elastinolytic metalloproteinase precursor, putative  40.62 
 
 
831 aa  99.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  42.95 
 
 
1053 aa  92.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  39.11 
 
 
1107 aa  89  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.65 
 
 
833 aa  87.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.85 
 
 
1292 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.54 
 
 
1286 aa  84  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  32 
 
 
848 aa  83.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2538  coagulation factor 5/8 type-like protein  29.25 
 
 
1043 aa  82.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 
1212 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1810  peptidase M36, fungalysin  28.63 
 
 
1146 aa  79.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.3 
 
 
855 aa  79  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  42.48 
 
 
1147 aa  78.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
1283 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 
863 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  31.98 
 
 
848 aa  76.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  40.16 
 
 
1258 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  36.42 
 
 
869 aa  75.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  49.38 
 
 
1220 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  34.62 
 
 
868 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  30.96 
 
 
1265 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.62 
 
 
868 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  31 
 
 
994 aa  73.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  44.26 
 
 
567 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.62 
 
 
868 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  35.44 
 
 
868 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  43.44 
 
 
567 aa  72  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
868 aa  72  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  34.81 
 
 
867 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 
868 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.82 
 
 
1399 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.14 
 
 
1323 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.74 
 
 
911 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  27.39 
 
 
1321 aa  66.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.05 
 
 
972 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  45.65 
 
 
1215 aa  65.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.9 
 
 
913 aa  64.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.13 
 
 
1750 aa  64.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.34 
 
 
1217 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  39.13 
 
 
816 aa  63.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  41.9 
 
 
1042 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3303  chitinase domain-containing protein  31.28 
 
 
814 aa  64.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  28.28 
 
 
985 aa  63.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.05 
 
 
1212 aa  62.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1624  hypothetical protein  29.85 
 
 
634 aa  62  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.15 
 
 
1212 aa  62  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3266  peptidase M36 fungalysin  31.8 
 
 
1168 aa  61.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0508645  normal  0.0224871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.15 
 
 
1212 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.41 
 
 
765 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  34.38 
 
 
571 aa  60.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  37.98 
 
 
568 aa  58.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  33.73 
 
 
1022 aa  58.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  35.09 
 
 
591 aa  58.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  43.3 
 
 
528 aa  57  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.24 
 
 
728 aa  56.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  26.63 
 
 
989 aa  55.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  34.4 
 
 
1421 aa  55.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  31.76 
 
 
1725 aa  55.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  35.56 
 
 
702 aa  55.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  26.47 
 
 
1287 aa  54.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  30.17 
 
 
514 aa  54.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.39 
 
 
773 aa  54.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  35.92 
 
 
1315 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 
860 aa  53.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.24 
 
 
1776 aa  52.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.32 
 
 
927 aa  52.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.05 
 
 
891 aa  52.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  28.52 
 
 
1215 aa  52  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.52 
 
 
1215 aa  52  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  36.88 
 
 
1631 aa  52  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
1212 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3193  putative lipoprotein  29.68 
 
 
647 aa  51.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.52328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.51 
 
 
3474 aa  51.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  31.16 
 
 
635 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  35.62 
 
 
1035 aa  50.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  32.48 
 
 
1011 aa  50.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  47.54 
 
 
1962 aa  50.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  30.88 
 
 
560 aa  49.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  38.36 
 
 
809 aa  49.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  36.14 
 
 
2153 aa  48.9  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  35.58 
 
 
587 aa  48.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  33.66 
 
 
513 aa  48.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  33.87 
 
 
635 aa  48.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  35.58 
 
 
553 aa  48.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  35.58 
 
 
587 aa  48.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  35.58 
 
 
587 aa  48.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>