More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0049 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  87.53 
 
 		 401 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  80.3 
 
 		 402 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  91.77 
 
 		 402 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  87.78 
 
 		 401 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  86.78 
 
 		 401 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  87.28 
 
 		 401 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  97.01 
 
 		 401 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  98 
 
 		 401 aa  801    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  100 
 
 		 401 aa  818    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  61.81 
 
 		 401 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  62.06 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  59.8 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  60.3 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  60.35 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  56.17 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.59 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.06 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  43.26 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.89 
 
 		 446 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  39.55 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  38.79 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  41.1 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.72 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  41.8 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  39.71 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.9 
 
 		 463 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 		 438 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 		 438 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.3 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.04 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 437 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.86 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.75 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.06 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.55 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.63 
 
 		 445 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.63 
 
 		 445 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.3 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  41.72 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.06 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 423 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 		 410 aa  249  9e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.48 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.31 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  39.63 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 		 507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.44 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  38.03 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.4 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 535 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 455 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 477 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.33 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  36.2 
 
 		 515 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  36.62 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.68 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 515 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 		 477 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 515 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 515 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 440 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.57 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.25 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 550 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  36.29 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.2 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 513 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 446 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  37.89 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 		 424 aa  239  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 		 511 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  38.42 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  34.72 
 
 		 538 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>