More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.39363e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  58.41 
 
 
244 aa  254  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  58.26 
 
 
295 aa  239  3e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  48.84 
 
 
207 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  46.6 
 
 
219 aa  175  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.39 
 
 
206 aa  174  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  43.56 
 
 
219 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.48 
 
 
207 aa  163  2e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22791e-05 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  39.15 
 
 
203 aa  163  2e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.34 
 
 
213 aa  163  2e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.37 
 
 
686 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  42.45 
 
 
215 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.39 
 
 
221 aa  162  4e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  49.43 
 
 
232 aa  161  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.18 
 
 
225 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  43.48 
 
 
207 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.81 
 
 
671 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.03 
 
 
216 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  45.55 
 
 
901 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.81 
 
 
212 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.39 
 
 
688 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.12 
 
 
210 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.29 
 
 
210 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  48.3 
 
 
226 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.95 
 
 
215 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.44 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.06 
 
 
210 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  38.76 
 
 
211 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.19 
 
 
205 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.76 
 
 
222 aa  152  3e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.72 
 
 
213 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.33636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.36 
 
 
229 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  41.71 
 
 
210 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  43.3 
 
 
226 aa  152  6e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  41.95 
 
 
686 aa  151  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.9 
 
 
216 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.72 
 
 
210 aa  151  9e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.33 
 
 
688 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  43.92 
 
 
207 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.9 
 
 
217 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.58 
 
 
707 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  43.96 
 
 
224 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  41.46 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  39.25 
 
 
211 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.75 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  42.56 
 
 
207 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  42.38 
 
 
210 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  37.32 
 
 
209 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.77122e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.84 
 
 
213 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.65 
 
 
234 aa  148  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  41.23 
 
 
212 aa  147  1e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  37.91 
 
 
210 aa  147  2e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  43.96 
 
 
211 aa  147  2e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.23 
 
 
220 aa  147  2e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  42.13 
 
 
225 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.25 
 
 
224 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  41.38 
 
 
207 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  39.25 
 
 
225 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.23 
 
 
217 aa  145  4e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.6403e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  42.52 
 
 
210 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  41.38 
 
 
225 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40.65 
 
 
705 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.62 
 
 
233 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  7.2842e-09 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  42.29 
 
 
208 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  42.52 
 
 
210 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  39.42 
 
 
234 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  42.05 
 
 
203 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.33 
 
 
214 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  38.32 
 
 
214 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.21 
 
 
208 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  45.74 
 
 
212 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  42.72 
 
 
707 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.44 
 
 
703 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.92 
 
 
204 aa  140  1e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  37.38 
 
 
217 aa  141  1e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.18 
 
 
223 aa  140  1e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  38.24 
 
 
223 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  40.62 
 
 
216 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  38.24 
 
 
223 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  40.58 
 
 
215 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  38.97 
 
 
221 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  40.47 
 
 
225 aa  139  4e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  40.71 
 
 
244 aa  139  5e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  47.62 
 
 
210 aa  138  8e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  33.33 
 
 
213 aa  138  9e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.87 
 
 
206 aa  138  9e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40 
 
 
212 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  40.58 
 
 
214 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.7 
 
 
202 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40.91 
 
 
199 aa  136  3e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  37.81 
 
 
212 aa  136  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  37.17 
 
 
234 aa  136  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  37.81 
 
 
212 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  36.11 
 
 
211 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.02 
 
 
208 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  36.82 
 
 
212 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  38.3 
 
 
213 aa  135  6e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  41.81 
 
 
222 aa  135  6e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  37.5 
 
 
236 aa  135  6e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.43 
 
 
208 aa  135  7e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>