287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0996 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  72.97 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  69.67 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  69.67 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  69.67 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  69.33 
 
 		 300 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  427  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  68.44 
 
 		 301 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  68 
 
 		 300 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  67.67 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  66.78 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  68.97 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  67.01 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  70.73 
 
 		 302 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  63.09 
 
 		 301 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  47.48 
 
 		 287 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  46.72 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  46.72 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  46.72 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  45.64 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  45.64 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  45.67 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  45.49 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  42.91 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  45.14 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  45.24 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  44.89 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  44.53 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  43.8 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  43.42 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  42.91 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  42.51 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  41.64 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  39.22 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.36 
 
 		 820 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.98 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.39 
 
 		 632 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1276 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.63 
 
 		 988 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.58 
 
 		 706 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 3145 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.53 
 
 		 1694 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 1022 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.02 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.13 
 
 		 818 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 1005 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.32 
 
 		 561 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.77 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.32 
 
 		 561 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 634 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 		 629 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.21 
 
 		 738 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 414 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 878 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 2240 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1421 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1828  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 633 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0732208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 1034 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1121 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 699 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 499 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1276 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4079 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.65 
 
 		 810 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 		 1240 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  34.41 
 
 		 745 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>