124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1828 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1828  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 633 aa  1278    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0732208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2162  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  37.38 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.58 
 
 		 1022 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.65 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.14 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.16 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.69 
 
 		 706 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  26 
 
 		 297 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 361 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 750 aa  55.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.88 
 
 		 462 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  32.41 
 
 		 518 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 352 aa  54.3  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 818 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 541 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.31 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  28.81 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 306 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.91 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 421 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.88 
 
 		 539 aa  51.6  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  24.88 
 
 		 303 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 1421 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  50.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  28.72 
 
 		 205 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  30.28 
 
 		 233 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 		 474 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.03 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 836 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  30.36 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  24.38 
 
 		 296 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  34.41 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  25 
 
 		 303 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 174 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 249 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 927 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 290 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 291 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.88 
 
 		 820 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 349 aa  48.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 205 aa  48.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 280 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 605 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 246 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 308 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.79 
 
 		 471 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 235 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  31.53 
 
 		 1240 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 280 aa  47.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 391 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  29.41 
 
 		 358 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 301 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  26.54 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  26.54 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  26.54 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 292 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 923 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  26.23 
 
 		 415 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  28.95 
 
 		 300 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  28.95 
 
 		 300 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  28.95 
 
 		 300 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 232 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 4079 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  25.2 
 
 		 302 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2147  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.39 
 
 		 283 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0794715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  27.16 
 
 		 294 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 		 1034 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 547 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 213 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  30.65 
 
 		 295 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  26.54 
 
 		 294 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 343 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 189 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 219 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  28.95 
 
 		 300 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>