212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0954 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  100 
 
 		 451 aa  930    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  63.37 
 
 		 447 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  40.48 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  29.37 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2604  hypothetical protein  21.88 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  30 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.46 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.5 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.09 
 
 		 494 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.39 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  22.17 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  26.58 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  25.62 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  25.94 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  22.75 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  22.48 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  22.72 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  26.85 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  21.04 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  26.15 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  26.58 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  25.59 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  25.59 
 
 		 530 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  25.59 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  25.59 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 530 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  25.59 
 
 		 524 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 		 515 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.86 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 710 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  25.85 
 
 		 468 aa  57  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.13 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  26.61 
 
 		 522 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  24.9 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  27.75 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  24.9 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  24.14 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  25.66 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  24.73 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  26.61 
 
 		 526 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  21.14 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  23.7 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 379 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  24.02 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  22.19 
 
 		 478 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  28.06 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  21.81 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 530 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  32.29 
 
 		 337 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  22.32 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  26.5 
 
 		 569 aa  53.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  23.83 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  30.41 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  23.4 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08930  periplasmic protease  30.41 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135221  normal  0.0516664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  25.59 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  25.37 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  25.29 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  26.77 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  26.47 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  26.47 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  24.52 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  26.13 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  24.68 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1277  peptidase S41  20.53 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233163  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  23.47 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>