More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3035 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  95.53 
 
 		 828 aa  1617    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  72.17 
 
 		 827 aa  1245    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  86.38 
 
 		 837 aa  1476    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  63.85 
 
 		 912 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  95.53 
 
 		 828 aa  1588    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  64.48 
 
 		 919 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  100 
 
 		 828 aa  1676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  85.9 
 
 		 837 aa  1469    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  85.78 
 
 		 837 aa  1468    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  46.61 
 
 		 921 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  43.79 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  43.81 
 
 		 919 aa  617  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  43.4 
 
 		 931 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  59.83 
 
 		 920 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  39.38 
 
 		 869 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  39.15 
 
 		 852 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  43.26 
 
 		 915 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  37.28 
 
 		 869 aa  595  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  38.93 
 
 		 833 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  41.24 
 
 		 922 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.28 
 
 		 920 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  42.37 
 
 		 897 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  35.01 
 
 		 948 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.98 
 
 		 781 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  33.19 
 
 		 1055 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 834 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.42 
 
 		 869 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  29.84 
 
 		 977 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 952 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 936 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 830 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 849 aa  303  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 846 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 800 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 824 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 940 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  30.18 
 
 		 812 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 791 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 823 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 947 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.33 
 
 		 568 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 753 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  34.63 
 
 		 779 aa  248  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 830 aa  247  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.04 
 
 		 877 aa  218  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.83 
 
 		 877 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  31.61 
 
 		 875 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.83 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.98 
 
 		 803 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  38.04 
 
 		 576 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 473 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  35.62 
 
 		 425 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 605 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.12 
 
 		 579 aa  105  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  21.85 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  25.3 
 
 		 606 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  21.74 
 
 		 700 aa  102  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  28.99 
 
 		 552 aa  101  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 387 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 388 aa  99.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 992 aa  98.6  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.2 
 
 		 552 aa  97.8  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.53 
 
 		 552 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.64 
 
 		 552 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 379 aa  95.1  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.01 
 
 		 551 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25 
 
 		 495 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.47 
 
 		 609 aa  93.6  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 537 aa  94  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  24.75 
 
 		 495 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  31 
 
 		 508 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 516 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  22.47 
 
 		 703 aa  91.3  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23 
 
 		 495 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.09 
 
 		 603 aa  90.9  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 587 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.2 
 
 		 992 aa  88.2  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.53 
 
 		 362 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  23.87 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  26.29 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.36 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.48 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.48 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.48 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.48 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 392 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>