More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1489 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 369 aa  742    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  93.48 
 
 		 369 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  63.66 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  62.01 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  65.35 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  60.56 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  59.89 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  62.64 
 
 		 352 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  61.5 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  60.11 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  58.84 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  60.11 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  60.39 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  59.78 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  57.97 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  58.97 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  55.1 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  56.11 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  56.87 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  58.33 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  54.62 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  56.99 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  54.57 
 
 		 353 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  55.59 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  54.52 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  50.12 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  52.62 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  57.91 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  52.35 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  52.35 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  51.96 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  51.78 
 
 		 359 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  51.96 
 
 		 342 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  48.84 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  44.72 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  50.93 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  48.49 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  46.36 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  45.22 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  47.16 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  42.36 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  45.64 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  44.71 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  44.8 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  43.35 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  42.42 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  42.25 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  42.25 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  37.79 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  36.06 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  39.23 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  31.64 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.63 
 
 		 495 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.91 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.77 
 
 		 582 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  27.61 
 
 		 902 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  24.93 
 
 		 307 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  26.74 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  31.14 
 
 		 656 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  31.18 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  27 
 
 		 608 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  29.34 
 
 		 847 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  35.43 
 
 		 847 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  31.78 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 766 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.41 
 
 		 522 aa  93.6  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  29.24 
 
 		 316 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  31.17 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  29.03 
 
 		 603 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  28.31 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  28.24 
 
 		 877 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  30.57 
 
 		 816 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  30.09 
 
 		 843 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 520 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 520 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 520 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  26.75 
 
 		 861 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  28.49 
 
 		 918 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  29.36 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  32.68 
 
 		 825 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.72 
 
 		 509 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  31.73 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  30 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  28.07 
 
 		 871 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  31.73 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  32.74 
 
 		 828 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  28.82 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.61 
 
 		 797 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  27.42 
 
 		 822 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  24.78 
 
 		 818 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  32.02 
 
 		 477 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  26.04 
 
 		 658 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.72 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  35.59 
 
 		 845 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0365  ATP dependent DNA ligase  24.69 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  29.01 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  32.03 
 
 		 759 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  29.18 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>